Для начала СМАРТ на винте посмотреть. При плохом шлейфе будет много софт бедов и ошибок коррекции. При плохом харде будет в добавок к этому большой % хардварных бедов и, возможно, ошибок позиционирования.
Если две оси стоит, можно попробовать сделать те же манипуляции в другой и посмотреть реакцию.
В Вин7 поставить дефолтные драйвера на контроллер, если стоят фирменные, или наоборот, если наоборот